Hậu quả của cái chết của Puerta, vòng loại UEFA Champions League của Sevilla trong trận đấu với AEK Athens F.C. đã bị hoãn lại cho đến ngày 4 tháng 9[10] - Sevilla cuối cùng đã giành được 4-1. Câu lạc bộ cũng thông báo rằng một phút im lặng sẽ được tổ chức trước mỗi trận đấu giải đấu vào cuối tuần 1 Tháng 2 năm 2007.

Ngoài ra, trận đấu Siêu cúp UEFA của Sevilla với A.C. Milan vào ngày 31 tháng 8 đã diễn ra như một sự tôn vinh cho người chơi, với tất cả 22 người tham gia có tên 'PUERTA' được in ở mặt sau áo của họ. Các cầu thủ và quan chức hai bên cũng đeo băng tay màu đen.[11]

Sevilla sau đó đã loại bỏ áo số 16 của Puerta,[12] với điều khoản là con trai của anh, Aitor Antonio (sinh ngày 22 tháng 10 năm 2007),[12] một ngày chơi cho câu lạc bộ, ông sẽ có tùy chọn để đưa số đã bỏ.[13] Tuy nhiên, các đội bóng đá Tây Ban Nha không được phép làm như vậy, vì Liên đoàn bóng đá Hoàng gia Tây Ban Nha tuyên bố rằng các câu lạc bộ nên sử dụng số 1 đến 25 cho đội hình thông thường của họ, không có thêm chỗ để điều động; kết quả là David Prieto đã mặc chiếc áo này vào năm 2007, 08 để vinh danh bạn mình nhưng sau đó đã quyết định rằng chỉ những sản phẩm dành cho giới trẻ mới có thể mặc chiếc áo đó.

Một cách tranh cãi, con số đã được trao cho người Argentina Federico Fazio năm 2016.[14] Một năm sau, nó đã được trao cho Jesús Navas, một người bạn thân của Puerta, khi anh trở lại câu lạc bộ vào năm 2017.[15]

Ramos mặc áo phông để tưởng nhớ Puerta sau khi Tây Ban Nha vô địch UEFA Euro 2008 và 2010 FIFA World Cup, với Navas cũng làm như vậy trong dịp thứ hai.[16] Trước đó vào năm 2010, một bức tượng của ông đã được xây dựng trong các cơ sở thể thao của câu lạc bộ Jose Ramón Cisneros Palacios;[17][18] hơn nữa, Ramos đã có một hình xăm Ngôi sao David trên cánh tay để tưởng nhớ Puerta vì sau này là người Do Thái.[19]